Wiśnia jest bogatym źródłem flawonoidów, zwłaszcza: cyjanidyny, antocyjanidyny, proantocyjanidyn, a także flawonoli: kwercetyny i kamferolu. Związki te nadają owocom czerwono-niebieską barwę. Im ciemniejsze wiśnie, tym wyższe stężenie tych substancji. Flawonoidy zawarte w owocach wiśni odpowiadają za ich prozdrowotne właściwości.
Owoce wiśni zawierają również melatoninę i alkohol perillylowy. Obecne są też związki garbnikowe, a z kwasów fenolowych – kwas elagowy.
Najpopularniejszymi kwasami organicznymi występującymi w owocach wiśni są kwasy: jabłkowy i cytrynowy oraz karotenoidy (barwniki), głównie beta-karoten, zeaksantyna i luteina. Owoce w 100 g świeżej masy zawierają 82 85% wody, 10,9 12,18 g węglowodanów prostych (głównie fruktozę), 1,6 3,0 g błonnika, nieznaczne ilości białka 0,9 1,0 g oraz tłuszczu 0,3 0,4 g (2, 4).
